南通市种子质量监督检测中心是依法设置的农作物种子质量监督检验机构，是南通市种子管理站下属的非独立法人机构，主要任务是受南通市农业局委托承担南通市种子市场的种子质量监督检验任务，接受委托检验；检验项目为农作物品种的真实性和纯度、净度、发芽率、水分等。2004年和2009年两次通过江苏省质量技术监督局机构认可和计量认证的复评审
南通市种子质量监督检测中心建有办公室（样品保管室和档案保管室）、检验室（天平室、净度分析室、水分测定室、发芽试验室、真实性和纯度检验室），实验室总面积780平方米。仪器设备齐全、先进，拥有仪器设备106台（套），其中先进进口设备10台（套）。管理人员、检验人员素质较高，现有职工10人，其中6人有农作物种子扦样员、田间检验员、室内检验员资格。
